Такий вид фізіотерапії широко застосовується у багатьох напрямах медицини: косметологія, гінекологія, дерматологія, хірургія, терапія, урологія, неврологія, офтальмологія тощо.

Захворювання, при лікуванні яких використовується озонотерапія:

• серцево-судинні захворювання, спричинені низьким рівнем кисню в серцевому м'язі;
• гіпертонія;
• хронічний гастрит;
• виразкова хвороба;
• запальні процеси в товстій та прямій кишках;
• захворювання печінки;
• хронічна втома;
• цукровий діабет;
• захворювання суглобів;
• онкологія.

В гінекології озонотерапія використовується в лікуванні багатьох захворювань таких як:

• безпліддя;
• гострі або хронічні запальні процеси;
• хронічна вірусна інфекція;
• дистрофічні захворювання вульви;
• реабілітація після операційного втручання;
• профілактика ускладнень після операцій;
• попередження формування спайкового процесу;

У косметології озонотерапія допомагає у вирішенні проблем:

• акне;
• целюліт;
• ожиріння;
• вікові зміни еластичності шкіри;
• шрами, рубці;
• алопеція;
• в'янення шкіри, погіршення кольору обличчя.

В акушерстві озонотерапія дає можливість насичувати кров киснем для посилення кровопостачання плаценти та плоду. Така фізіотерапія нормалізує гормонопродукуючі процеси, регулює клітинний обмін та імунітет.